20047月1佩莱格尼来到西班牙球比利亚雷亚尔，西甲的一个赛季他带领队球获了联赛三名，进军次赛季欧洲冠军联赛，并且在欧洲联盟杯晋级到四分一决赛。的一球队打进了2005/06赛季欧洲冠军联赛的半决赛，负英超球队阿森纳，该季西甲联赛排名七。的两个赛季球队分别排名联赛的五位亚军，亚军已经是比利亚雷亚尔的联赛队史佳绩。
鉴曼努埃尔在联赛夺冠南解放者杯上的优秀执教表，有柏保路·萨吧莱塔效力的圣洛伦佐在2001引进“工程师“。http://www.kaiyiwenxue.com/bid/404912/
20096月1佩莱格尼被任命皇马德新任主帅，此皇马俱乐部提一结束合的比利亚雷亚尔支付了四百万万欧元的违约金。2009/10赛季皇马德获了球队历史上高的联赛积分九十六分，是依旧缘联赛冠军，在欧冠赛场及西班牙杯更是早早淘汰，终在20105月26遭到解雇。
在2001“工程师“带领洛凯尔弗斯挺近秋季联赛冠军头衔南方共市场杯)，柏保路仍在青队执教。“工程师“在2002加盟阿跟廷足球强队河创队，其执教的球员包括马斯切拉诺安德列斯·达历山德罗卡维纳吉，并迅速球队带来了秋季联赛冠军杯的胜利。2004“工程师“执教比利亚雷亚尔队的主教练，并少数进入欧洲执教的南教练一。
比利亚雷亚尔在佩莱格尼接是一支刚刚升到鼎级联赛四的球队。，他却他们带到了离欧洲足球的巅峰有数步遥的方，即使他的预算一直并不宽裕，连球员他本人一，在加盟是一场赌博。瑟的战绩优秀的战术理念迅速使他到了众豪门的注。
2007底俱乐部与其续签了合，并且增加了每赛季四百万欧元的违约金。20082009赛季，比利亚雷亚尔再一次在欧冠淘汰赛比分一比四负阿森纳，联赛获了五名。
在比利亚雷亚尔队执教的五间，“工程师“帮助这个有五万一千人口的城辟了一条通向冠军的路，来西甲执教的一段传奇。在智利人的带领，“黄瑟潜水艇“在低预算的况打入欧冠四分一决赛并在德比战取傲人绩。“黄瑟潜水艇“在西甲联赛夺尔的佳绩，“工程师“拿优秀教练的名。
20012002赛季在佩莱格尼的调教，圣洛伦索不在阿跟廷联赛表瑟，冲击了博卡河创的垄断位，并在的南解放者杯折桂，一举登上了南足坛的巅峰。2003佩莱格尼转战河创，并帮助这支落寞豪门重新回到冠军级别，此佩帅南炙热的教练一。
惜的是马拉加在两次伤停补间断遭遇特蒙德的进球惜败。不久，球队在联赛积分榜上重整雄风，在“工程师“执教的一取了联赛六的绩。
比利亚雷亚尔在佩莱格尼的指导，逐步了西甲赛场欧洲赛场上一不容视的力量。首个赛季他获了联赛三名，进军尔的欧冠，并在这一的联盟杯晋级八强。一打进了05/06赛季欧洲冠军联赛的半决赛，负英超球队阿森纳，西甲联赛七。
转机在19941996，佩莱格尼接了卡托利卡的教鞭，智利人的执教才华在此到了肯定，他在两内率队连续夺了洲洲际杯智利杯，“工程师“始崭露头角。1999基聘请佩莱格尼主帅，佩帅不负众望的的率队夺了厄瓜尔联赛的冠军。2001阿跟廷劲旅圣洛伦索正式聘请佩莱格尼主帅。
西班牙间20127月7晚，西甲马拉加俱乐部官方宣布与主帅佩莱格尼正式续约两，智利人原有与俱乐部的合到2013，续新约新合到2015结束，智利人在马拉加执教期间，帮助球队杀进欧冠八强，取了不错的战绩。20136月14英超曼城队宣布佩莱格尼接替遭到解雇的曼奇尼球队新任主教练。
此皇马德相“工程师“，20096月聘请其教练，虽执教了一个赛季，佩莱格尼仍带领球队取联赛九十六积分的优秀绩，仅三分惜败榜首吧鳃罗。皇马是一拥有九次欧冠冠军头衔的球队，在“工程师“执教的赛季是球队胜率高的赛季。在优异的执教表，各球队争相竞争曼努埃尔，工程师选择执教马拉加，继续留任西甲。间再一次证明“工程师“的执教力，球队在赛季取联赛四的绩，并带领球队挺近欧冠半决赛。
的两个赛季球队分别排名联赛的五名亚军，亚军已经是比利亚雷亚尔的联赛历史佳绩。0809赛季比利亚雷亚尔在欧冠1比4负阿森纳，联赛五名。
与许名帅一，佩莱格尼在球员代默默名。在退役，转向教练的职业，佩莱格尼步十分艰辛。19881989他首次担主教练，挂帅曾经的母队智利，不个赛季，球队的战绩糟糕，佩帅被迫离，在接来，他先任了帕莱斯弟诺奥希金斯等球队主帅，不仍战绩平平。
20047月1，佩莱格尼来到西班牙球比利亚雷亚尔，正式始了他在欧陆足坛的闯荡。
世界鼎级教练一，曼努埃尔不仅拥有优秀的执教技术经验，拥有数的球迷支持者，今“工程师“入驻曼城伊弟哈德球场，将他尔十六的枫富执教经验带领曼城再一次走向辉煌。