在马芳挫阿勒坦，王崇古派百户鲍崇德使与阿勒坦谈，经一番辩论，阿勒坦终屈缚“若封我王，统辖北方诸部，我约令称臣，永不复叛。”到阿勒坦承诺，双方达协议：阿勒坦向明朝交叛逃至蒙古的赵全等人，明朝册封汉纳吉指挥使，礼送回阿勒坦处。
在神宗即位的政治斗争，原内阁首辅高拱失势被逐，士张居正取代，随身高拱亲信的王崇古，被御史陈堂弹劾“弛防徇敌”，不不引咎辞职，马芳随未幸免。他担不通阅视，是贿赂武库司郎林绍、怀隆及兵备参议吴哲、阅视侍郎吴百朋，吴百朋告此，奏请朝廷提审马芳。经兵部尚书杨博，神宗革马芳的职务，勒令他“归闲珠”。
阿勒坦在北的晾马台正式举“顺义王受封宣誓”的仪式，歃血盟誓“世世代代，永不复叛”。此誓果真，不蒙古其他部落有，至“河套各部皆求归附”，且“边鄙安，蓟宣抵甘固，六十余边民息，遂长不识兵革。”此结束了明蒙双方的规模战争，达了著名的“隆庆议”。
“隆庆议”功，马芳兵，在每五月，受命率经兵护送王崇古到北的弘赐堡接见蒙古各部首领，宣扬明朝威德，每次马芳部皆“兵甲威武，诸部皆拜缚”。
妥善安置汉纳吉，一向明朝提议趁机招抚阿勒坦。主政的高拱、张居正两位士皆此全力支持，偏巧此阿勒坦的长辛爱虽假兵协助阿勒坦，其实却按兵不，企图借阿勒坦与明朝血拼的机谋夺权力。
阿勒坦向朝廷索封赏，并威胁兵戎相见，朝廷立刻命马芳挂印，充任宣府兵官。马芳到任，整治兵马，在宣府郊外率领骑兵举了数次“游猎”，蒙古各部闻讯惊：“马太师归。”阿勒坦急忙向朝廷“奉表谢罪，痛悔。”原本一触即的兵祸此消解。马芳因病请辞，解甲归乡，在乡蔚州逝世，享六十四岁，神宗闻讯，按例赐祭葬。
阿勒坦逮捕赵全、李馨、王廷辅、赵龙、张彦文、刘麟、马西川、吕西川、吕劳至明朝，明朝约将汉纳吉礼送归蒙古，防阿勒坦报复，明朝使臣更警告阿勒坦“汝孙今朝廷命官，不轻辱。”是阿勒坦与汉纳吉祖孙俩“相抱哭，连连南向叩头。”阿勒坦更明朝“遣使报谢，誓不犯”，交换人员，阿勒坦主示，令昆力，吉等蒙古部落停止明朝边境的侵扰，王崇古向明朝廷上奏，建议明朝“先朝忠顺王故”册封阿勒坦，“许贡入京”，且在边境上放互市，实明蒙双方的长期平。虽有朝臣指责王崇古“邀近功，忽远虑”，因士高拱、张居正等人支持，明朝终诏册封阿勒坦“顺义王”，其兄弟侄部皆受封督、知、千户等官职，在延绥，红山敦，宁夏清水营等设“互市”，恢复汉蒙两族边民贸易。